Когато сгъстеният въздух влезе в досег с храните или с повърхностите за обработка на хранителни продукти, съществува възможност за заразяване от микроби (както и с гъбички и плесени, които съкращават срока на годност на продуктите). За решаването на този въпрос определящ е изборът на правилно филтриране на сгъстения въздух, което гарантира безопасността на храните